Виртуальная клетка поможет ученым при создании новых лекарств

Проект реализуется исследовательской группой Научно-технологического университета «Сириус» с поддержкой Российского научного фонда (РНФ). В основе разработки лежат мультиомиксные технологии, которые объединяют данные о ДНК, белках и РНК, что позволяет моделировать клеточные реакции на изменения различных факторов.

Виртуальная клетка позволит ученым проверять гипотезы на начальном этапе исследований и моделировать взаимодействия на молекулярном уровне. Это сэкономит время и ресурсы в медицинских исследованиях.

Федор Колпаков, научный руководитель направления «Вычислительная биология» Научно-технологического университета «Сириус»:

— Математическая модель в каком-то смысле является высшей формой моделирования. Таким образом, построение математической или компьютерной модели — это систематизация существующего знания о работе клетки. Мы сводим сведения экспериментальных данных в модель. Построение такой детальной виртуальной клетки позволит существенно расширить наше понимание работы реальной клетки.

На сегодняшний день подобные модели существуют только для простых организмов, таких как бактерии. Проект Университета «Сириус» предполагает несколько этапов: сбор данных, их анализ и интеграцию, метаанализ и построение модели.

Для создания виртуальной клетки используется платформа BioUML, которая уже помогла разработать модели процессов клеточной смерти и регуляции артериального давления. Проект открытый для сотрудничества и реализуется с участием аспирантов и магистрантов программы «Биоинформатика», планируется его завершение к 2026 году.