В ходе Великой Отечественной войны театр кукол единственный в Советском Союзе готовил постановки для детей. Любовь к Родине тогда воспитывали такие спектакли как «За великую землю Советскую» и «Армейские сказки». Старожилы театра отмечали, что зрительные залы школ и клубов, где ставились спектакли, всегда были переполнены.
Спектакли не ограничивались только оренбургским зрителем. Труппа гастролировала по другим областям и республикам, в том числе и по освобожденным от немецкой оккупации. Медалями «За доблестный труд в Великой Отечественной войне» были награждены восемь членов труппы того времени.
В послевоенные годы областной театр активно продолжил свою работу, разыгрывая по три постановки в день. В 1960 году артисты переехали в хорошо известное оренбуржцам здание на улице Советской. Сейчас в нем идет реконструкция.