Руководить экономикой Оренбурга он начал с 10 июля 2017 года. Что послужило поводом для расторжения трудового договора, в мэрии отказываются комментировать. Также неясным остается вопрос, кто теперь займёт вакантное место.
До Алексея Никишина Управление экономики и перспективного развития администрации Оренбурга возглавлял Дмитрий Рыжков. В должности начальника ему удалось продержаться чуть больше года.